Wegen der Milch bin ich mir jetzt nicht 100%ig sicher, da diese ja auch tierisches Eiweiß enthält... Ich würde auf jeden Fall erst mal weiter Pferd füttern und nun die Biopsie machen lassen, damit du eine abgesicherte Diagnose hast.
Wenn du mit der Ausschlussdiät aufhörst, müsstest du erst mal eine "Konfrontation" machen, genau das Futter geben, was es früher gab. Wenn das dann zu keiner Verschlechterung führt, kann man davon ausgehen, dass es keine Futtermittelallergie ist.